На собна температура, скваленот е бистра, безбојна до бледожолта маслена течност со посебен мирис на масло од рибен црн дроб; е многу подложна на оксидација. Структурно, составен е од шест изопренски единици и содржи шест двојни врски, што го прави многу нестабилен. Нерастворлив е во вода, но лесно растворлив во органски растворувачи како што се диетил етер, ацетон и јаглерод тетрахлорид.